近日,星賽生物宣布EasySort單細(xì)胞微液滴分選系列產(chǎn)品升級(jí),在芯片、硬件及軟件三方面全維度創(chuàng)新和性能提升。其中,業(yè)內(nèi)首創(chuàng)光鑷輔助靜態(tài)池成像分選技術(shù)在芯片上的應(yīng)用可支持精確索引細(xì)胞分選,而新增的獨(dú)創(chuàng)EasySort AUTO自動(dòng)化模塊及相關(guān)軟件升級(jí),使得顯微鏡可以智能化發(fā)現(xiàn)目標(biāo)單細(xì)胞,并自動(dòng)化分離獲取,實(shí)現(xiàn)30秒內(nèi)“精準(zhǔn)擒拿”目標(biāo)活體單細(xì)胞,單細(xì)胞得率達(dá)93%。升級(jí)產(chǎn)品可以更智能化、自動(dòng)化的方式解決研究人員在單細(xì)胞分選環(huán)節(jié)一直以來的難題——“看得到,拿不出”,實(shí)現(xiàn)精細(xì)到不同細(xì)胞形態(tài)階段的“所見即所得”,為微生物資源的探測(cè)和挖掘提供了有力手段。
圖1:EasySort AUTO提升活體單細(xì)胞分選的自動(dòng)化與智能化程度
此前,星賽生物EasySort系列于今年年初發(fā)布,是一款可實(shí)現(xiàn)原位狀態(tài)下活性單細(xì)胞精準(zhǔn)分選的裝備,目前包括Lego(可將顯微鏡升級(jí)為單細(xì)胞分選儀)和Compact(高度集成化的單細(xì)胞智能分選儀)兩個(gè)型號(hào)。通過耦聯(lián)光鑷和微液滴技術(shù),EasySort為單細(xì)胞的觀測(cè)監(jiān)測(cè)、捕獲操縱、分離提取提供系統(tǒng)化解決方案。而此次產(chǎn)品升級(jí)進(jìn)一步應(yīng)用了多個(gè)業(yè)內(nèi)獨(dú)創(chuàng)專利技術(shù),使活體單細(xì)胞分析分選更精準(zhǔn)、更智能、更高效,為后續(xù)單細(xì)胞多組學(xué)研究提供了更多科研創(chuàng)新思路。
實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)顯示,升級(jí)EasySort系統(tǒng)搭載的AI輔助圖像識(shí)別算法對(duì)目標(biāo)細(xì)胞識(shí)別的準(zhǔn)確率達(dá)80%;系統(tǒng)嵌入的光鑷技術(shù)可以捕捉并精準(zhǔn)操控目標(biāo)細(xì)胞;基于界面接觸的微量液體分離專利技術(shù),目標(biāo)細(xì)胞能夠以單管單細(xì)胞(One-Cell-One-Tube)的形式自動(dòng)收集于PCR管中,通量為~120細(xì)胞/小時(shí),單細(xì)胞率高于93%。該系統(tǒng)分選的目標(biāo)單細(xì)胞可以直接開展單細(xì)胞測(cè)序、培養(yǎng)等工作,單細(xì)胞測(cè)序成功率高于84.2%,酵母細(xì)胞和大腸桿菌單細(xì)胞培養(yǎng)的成功率分別為~85%和~80%。相關(guān)科研成果近期發(fā)表于權(quán)威期刊《微生物》mLife。
芯片升級(jí):打造全新一代靜態(tài)池芯片,實(shí)現(xiàn)高通量的精確索引細(xì)胞分選
為了進(jìn)一步簡(jiǎn)化技術(shù)操作流程,提升分選通量,并進(jìn)一步支持大批量單細(xì)胞分析分選,星賽生物采用了基于OPSI的新一代單細(xì)胞分選耦合培養(yǎng)/測(cè)序策略,業(yè)內(nèi)首創(chuàng)光鑷輔助靜態(tài)池成像分選技術(shù),可以精確索引的方式對(duì)細(xì)胞進(jìn)行分類,能“所見即所得”、保持細(xì)胞原位活性、高通量地分選明場(chǎng)、熒光、拉曼成像下的目標(biāo)單細(xì)胞,并支撐高質(zhì)量的單細(xì)胞基因組/轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。該技術(shù)對(duì)于細(xì)菌、古菌、真菌、動(dòng)植物、人體等各種大小細(xì)胞均廣譜適用。相關(guān)工作得到了國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、山東省自然科學(xué)基金委和國家自然科學(xué)基金委的資助,相關(guān)研究成果發(fā)表于微流控領(lǐng)域國際權(quán)威期刊《芯片實(shí)驗(yàn)室》Lab on a Chip。
圖2:OPSI技術(shù)服務(wù)單細(xì)胞多組學(xué)研究
軟硬件升級(jí):全流程自動(dòng)化+獨(dú)家AI算法,目標(biāo)細(xì)胞識(shí)別更精準(zhǔn)高效
開發(fā)團(tuán)隊(duì)在原有版本產(chǎn)品基礎(chǔ)上新增了自動(dòng)化收集裝置——EasySort AUTO系統(tǒng)模塊,可實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化、智能化的從細(xì)胞群中精確分類不同形態(tài)的細(xì)胞。該系統(tǒng)由星賽生物聯(lián)合中國科學(xué)院青島生物能源與過程研究所單細(xì)胞中心開發(fā),支持EasySort產(chǎn)品在一次上樣之后,檢索、分選、收集等環(huán)節(jié)實(shí)現(xiàn)全流程自動(dòng)化。新增裝置通過將光鑷模塊和自動(dòng)采集模塊耦合到正置顯微鏡來構(gòu)建,安裝簡(jiǎn)便并適配奧林巴斯、尼康、徠卡和蔡司等多個(gè)顯微鏡型號(hào)。
產(chǎn)品同時(shí)升級(jí)了支持EasySort AUTO自動(dòng)化收集裝置的軟件,可對(duì)細(xì)胞進(jìn)行AI智能分析并精準(zhǔn)檢索目標(biāo)細(xì)胞,其智能分選路徑設(shè)計(jì),在光鑷鎖定細(xì)胞啟動(dòng)分選時(shí)還可以使其自動(dòng)避障。
多個(gè)權(quán)威期刊論文實(shí)驗(yàn)結(jié)果驗(yàn)證EasySort對(duì)單細(xì)胞多組學(xué)的創(chuàng)新研究?jī)r(jià)值
升級(jí)后的EasySort系列產(chǎn)品為研究人員提供了新一代的單細(xì)胞分選耦合培養(yǎng)/測(cè)序策略,提供了原位活體微生物單細(xì)胞分選的自動(dòng)化、基于精確索引和保持細(xì)胞活力的解決方案,并已成功支持多個(gè)相關(guān)實(shí)驗(yàn)研究。
例如,研究人員成功的利用AI輔助檢測(cè)模型,實(shí)現(xiàn)單個(gè)細(xì)胞的形態(tài)圖像快速獲取并呈現(xiàn)預(yù)測(cè)結(jié)果。實(shí)驗(yàn)使用在亮度、形狀和質(zhì)地上都不同的兩種酵母來驗(yàn)證識(shí)別的準(zhǔn)確性。其中一種酵母對(duì)比度小、形狀圓潤、內(nèi)部紋理無明顯變化,而AI輔助檢測(cè)模型精準(zhǔn)的識(shí)別了相關(guān)特征。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示絕大多數(shù)酵母種類可以被正確分類,該研究成果發(fā)表于《微生物》mLife。
近期在《芯片實(shí)驗(yàn)室》Lab on a Chip發(fā)表的論文也展現(xiàn)了OPSI的通用性、方便性、靈活性和低成本等優(yōu)勢(shì),研究人員使用OPSI系統(tǒng)分選人體MCF-7單細(xì)胞進(jìn)行RNA-seq,獲得了高質(zhì)量和高可重復(fù)性的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組譜。
目前,升級(jí)版本EasySort產(chǎn)品已實(shí)現(xiàn)樣機(jī)下線及支持批量生產(chǎn),升級(jí)后的裝置及系統(tǒng)可與拉曼光譜儀耦合用于單細(xì)胞分析分選,將大大拓寬應(yīng)用范圍,其能將表型與基因型聯(lián)系起來的能力也為單細(xì)胞多組學(xué)提供了更多研究空間。